Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTCH1Q13635 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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