Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CUL4AQ13619 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
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