Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
CHAF1BQ13112 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
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