Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
STRN3Q13033 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms