Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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TRAF2Q12933 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TRAF2Q12933 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TRAF2Q12933 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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