Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
IFRD2Q12894 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms