Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
STX4Q12846 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
STX4Q12846 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms