Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BPTFQ12830 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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BPTFQ12830 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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BPTFQ12830 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BPTFQ12830 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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