Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SMARCB1Q12824 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMARCB1Q12824 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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