Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APOBRQ0VD83 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APOBRQ0VD83 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms