Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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FAM27E3Q08E93 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FAM27E3Q08E93 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FAM27E3Q08E93 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FAM27E3Q08E93 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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FAM27E3Q08E93 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
FAM27E3Q08E93 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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