Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PDE4BQ07343 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms