Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
POU5F1Q01860 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms