Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
IRF9Q00978 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IRF9Q00978 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
IRF9Q00978 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms