Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GTF2BQ00403 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms