Protein–RNA interactions for Protein: P83436

COG7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG7P83436 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COG7P83436 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COG7P83436 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COG7P83436 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms