Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HTRA4P83105 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms