Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MCCD1P59942 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms