Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GSCP56915 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GSCP56915 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GSCP56915 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GSCP56915 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.5 ms