Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH4P55283 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms