Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP7P55210 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP7P55210 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CASP7P55210 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CASP7P55210 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CASP7P55210 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms