Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CACNA2D1P54289 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms