Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RPIAP49247 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms