Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC004231.3-201ENST00000579136 258 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UTRNP46939 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC008440.1-201ENST00000455835 439 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UTRNP46939 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 OR51A9P-201ENST00000422578 911 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC091588.3-201ENST00000583442 770 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UTRNP46939 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UTRNP46939 WFDC5-202ENST00000372789 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms