Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ETFBP38117 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETFBP38117 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETFBP38117 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETFBP38117 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ETFBP38117 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms