Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SFNP31947 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SFNP31947 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SFNP31947 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SFNP31947 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFNP31947 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFNP31947 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFNP31947 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFNP31947 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFNP31947 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SFNP31947 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms