Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MARCKSP29966 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MARCKSP29966 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms