Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RPL18-205ENST00000549273 1036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 SEPHS2P1-201ENST00000511618 1162 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 NNMT-203ENST00000535401 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PTPRMP28827 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 KCNK18-201ENST00000334549 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 C10orf91-203ENST00000490765 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TGFBI-207ENST00000508076 1034 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL137077.2-201ENST00000635124 1608 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 RN7SL147P-201ENST00000487345 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CHRNA1-205ENST00000409542 1460 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 SIGLEC20P-201ENST00000595243 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PTPRMP28827 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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