Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXD10P28358 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms