Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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PTPRBP23467 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC13.83□□□□□ -0.19
PTPRBP23467 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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PTPRBP23467 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
PTPRBP23467 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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