Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCP2P22307 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SCP2P22307 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms