Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DESP17661 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DESP17661 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DESP17661 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms