Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PRF1P14222 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 HILPDA-202ENST00000435296 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PRF1P14222 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms