Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TNNT1P13805 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms