Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BCKDHAP12694 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms