Protein–RNA interactions for Protein: P12004

PCNA, Proliferating cell nuclear antigen, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNAP12004 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PCNAP12004 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PCNAP12004 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNAP12004 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNAP12004 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNAP12004 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PCNAP12004 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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