Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ESRRAP11474 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms