Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CHRNB1P11230 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms