Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ITGB3P05106 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms