Protein–RNA interactions for Protein: O75427

LRCH4, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH4O75427 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
LRCH4O75427 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.3 ms