Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PPFIA3O75145 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms