Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CEP104O60308 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CEP104O60308 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CEP104O60308 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms