Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PRKAB2O43741 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PRKAB2O43741 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms