Protein–RNA interactions for Protein: O43151

TET3, Methylcytosine dioxygenase TET3, humanhuman

Predictions only

Length 1,660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TET3O43151 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TET3O43151 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TET3O43151 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TET3O43151 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TET3O43151 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms