Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 SNX15-201ENST00000352068 771 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PGAP2-212ENST00000464906 1259 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRTO14522 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRTO14522 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
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