Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms