Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ERVV-1B6SEH8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms