Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
ODF3BA8MYP8 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms