Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SDR42E2A6NKP2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms