Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARID3CA6NKF2 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ZFAND2B-205ENST00000409319 771 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID3CA6NKF2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms